Алита: Боевой ангел

2563 год, триста лет со времён войны «Опустошения». В ходе катастрофической войны с Марсом Земля разорена, за исключением огромного летающего города Залема и поселения бедноты под ним — Айрон-Сити, прозванного также «Нижним миром».

Доктор Дайсон Идо в Нижнем мире находит на свалке мусора из Залема останки девушки-киборга. Доктор Идо даёт ей имя своей погибшей дочери — Алита и тело, которое ей же и предназначалось. Придя в сознание, Алита ничего не может вспомнить, но обнаруживает, что владеет боевыми приёмами киборгов, после чего начинает поиски утерянных воспоминаний.

Алита знакомится с молодым человеком Хьюго, который занимается поставкой различных запчастей доктору Идо. В городе действуют охотники за головами в лице боевых киборгов, преступники и представляющие Залем боевые роботы центурионы. В Нижнем городе запрещено огнестрельное оружие, чтобы не представлять угрозу Залему. Наказание за владение огнестрельным оружием — смерть.

Алита из сообщений местных СМИ узнаёт, что в городе появился убийца, который убил несколько женщин. Она начинает подозревать Идо, однажды вернувшегося с окровавленной рукой, после чего начинает за ним следить. Но в следующую ночь она узнаёт, что доктор является лицензированным охотником. В ходе схватки своего создателя с тремя преступными киборгами она убивает двух из них, дозволив скрыться третьему, обещающему отомстить — Гревишу. Во время схватки Алита вспоминает, что когда-то она в скафандре обучалась боевым искусствам на Луне.

Хьюго, встречаясь с Алитой, показывает ей различные знаковые места Нижнего города, знакомит её со вкусом шоколада, проводит на матч моторбола, от которого Алита в восторге. После матча выясняется, что команда Хьюго доставляет Вектору, организатору местных гладиаторских робогонок (моторбола), необходимые ему запчасти от других киборгов. Хьюго идёт с Алитой за город и показывает сбитый космический корабль сил СРМ (Соединённые республики Марса), которые некогда вступили в битву с Залемом и Землей. В космическом корабле Алита находит более совершенное кибернетическое тело той же модели, в котором она когда-то функционировала.

Алита просит доктора Идо подключить её к этому телу, но он не хочет её развития в качестве бойца, хоть она и была создана для этих целей. Алита с ним ссорится и узнаёт, что ей как минимум 300 лет, а в груди у неё бьётся сердце на основе утраченных технологий с питанием от реактора на базе антивещества, способное запитать целый Нижний мир. Тем временем Гревиш проходит апгрейд в мастерских Вектора с помощью доктора Кирен и получает вылетающие цепи-резаки, добытые ранее людьми Хьюго. Параллельно выясняется, что внутренний смотритель Залема — Нова, благодаря вживленному нейроимпланту может овладевать телом киборга или человека. В этот момент глаза подчиненного «раба» становятся голубыми, а Нова через него может напрямую общаться с горожанами.

После ссоры с доктором Идо Алита идёт в полицейское представительство Залема в Нижнем городе и получает лицензию охотника. Вместе с Хьюго она посещает бар для киборгов-охотников и произносит пламенную речь, направленную на борьбу с Гревишем, благодаря покровительству сверху на которого не объявляется награда, из-за чего охотники не могут его трогать. Алита задирает охотников, насмехается над нарциссизмом охотника Запана, который владеет мечом с утраченными технологиями. Запан пытается побить Алиту, но терпит унизительное поражение. Начинается массовая драка.

В бар приходит доктор Идо, который останавливает драку, пригрозив никому больше не помогать с бесплатными ремонтами. Вскоре появляется Гревиш с целью выполнить приказ Вектора — привести Алиту живой или мёртвой. Никто из охотников не желает вступать в бой с киборгом, который для демонстрации своего апгрейда немедленно убивает одного из их соратников, а затем — залаявшую на него собачку, которую Алита спасла от шагающего робота-центуриона в начале фильма. Алита кровью убитой собаки наносит на лицо боевую раскраску в виде полос под глазами и со словами «я не бездействую при виде зла» вступает в схватку с Гревишем.

Далее схватка переносится в подземный «мир» Гревиша, в ходе которой он успевает разрезать тело Алиты на куски, оставив ей одну руку. Алиту посещает видение из прошлого, в котором её коллега-наставница учит сражаться до конца. Алита вырывается, и оставшейся рукой в прыжке выбивает Гревишу правый глаз. В этот момент на помощь Алите приходят киборг-охотник с кибернетическими псами, Хьюго и Идо. Гревиш спасается бегством.

Доктор Идо приносит Алиту в свою лабораторию и подключает ее к боевому кибертелу, которое было найдено на космическом корабле сил СРМ. Находясь без сознания, Алита применяет тысячи микронастроек на новом теле. Придя в себя, она обнаруживает, что это тело значительно более совершенно, чем предыдущее. У Алиты в новом теле развиваются романтические отношения с Хьюго. Тот, по желанию Вектора, уговаривает её попробовать свои силы в моторболе, где против Алиты выставляют команду наёмников и убийц, целью которых является вовсе не игра, а убийство Алиты.

Тем временем Хьюго идёт на встречу со своими друзьями, которым объявляет об уходе из совместного дела. Неожиданно появляется Запан и убивает друга Хьюго и ранит самого Хьюго, который пускается в бегство. Скрываясь от Запана, он связывается с Алитой и просит помочь ему. Тем временем Алита, благодаря предвидевшему истинные цели её соперников по моторболу доктору Идо, уже расправилась почти со всеми противниками. Далее она пробивает большой телевизионный экран стадиона и спешит на помощь, по дороге добивая преследующих её оставшихся «спортсменов». Прибыв к месту встречи с Хьюго, она отбивает его у Запана. Охотник заявляет о пребывании Хьюго в розыске и обвиняет его в краже и незаконной продаже конечностей киборгов, а также убийстве. Хьюго признаётся во всём, кроме убийства, и пока Алита решает, что делать, Запан, недовольный её нерешительностью, протыкает Хьюго мечом. Алита уносит Хьюго в храм, где они говорят о чувствах. Кирен слышит их, у неё пробуждается жалость, и она решает помочь им.

Алита выходит из храма, неся с собой отрубленную голову Хьюго. Центурионы присуждают ей награду за поимку преступника. Однако Запан успевает заметить, что голова Хьюго прицеплена к сердцу Алиты, поддерживающему в нём жизнь. Охотник хватает девушку за руку, что центурионы трактуют попыткой отобрать награду, дающую Алите право на оборону. Алита отбирает меч у Запана и отрубает ему лицо. Кирен возвращается к Вектору, который уже знает, что она помогла Алите. Далее доктор Идо монтирует голову Хьюго к кибертелу и рассказывает, что когда-то сам жил в Залеме, но вынужден был спуститься вниз, так как наверху легального способа помочь его дочери справиться с болезнью не было. Он говорит, что Вектор обманывал Хьюго, когда обещал отправить его в Залем, человек Нижнего мира никогда не сможет попасть в Верхний, разве что став чемпионом моторбола. Другого способа нет. Также он упоминает Нову, и Алита вспоминает свою миссию по его убийству.

Алита отправляется к Вектору. В новом костюме и с мечом Запана она легко уничтожает всех его центурионов. Вектор говорит ей, что в Залем попасть всё-таки возможно, показывая органы Кирен, готовые к отправке наверх. В это время на Алиту нападает Гревиш, но, усилив клинок Запана своей плазмой, она легко его побеждает. В тело Вектора вселяется Нова. Алита убивает Вектора со словами, что он совершил ошибку, недооценив её. Связавшись с доктором Идо, Алита узнаёт, что за Хьюго продолжается охота и он решил забраться в Залем по одной из труб-канатов, ведущих в него. Догнав Хьюго, она умоляет его остаться с ней в Нижнем мире. Нова активирует систему защиты трубы-каната, в результате чего Хьюго был поврежден. Алита пытается спасти его, но он падает с огромной высоты.

Проходит 2 месяца. Алита становится звездой моторбола и выходит в высшую лигу, победа в которой даст ей право легально попасть в Залем.