Скуби-Ду

Венеция, штат Калифорния. Одинокий мальчик Шэгги спасает бездомного щенка от полицейского и называет его Скуби Дуби Ду. В ночь на Хэллоуин два хулигана отнимают у Шэгги и Скуби конфеты, бросив их в дом мистера Ригби, в котором живёт призрак. На помощь Шэгги и Скуби приходят Фред, Дафна и Велма. Дети заходят в особняк и подвергаются нападению призрака, но они ловко его нейтрализуют и обнаруживают, что призрак — переодетый мистер Ригби, а также находят секретную комнату с украденной дорогой электроникой. Полиция забирает Ригби в тюрьму, а пятеро друзей, довольные своим успехом в раскрытии преступления, решают заняться разгадкой тайн.

Проходит 10 лет. Велма предлагает сделать «Корпорацию „Тайна“» более профессиональной и находит инвестора — Саймона Коуэлла, известного телеведущего. Однако Коуэлл отказывается дать деньги из-за Шэгги и Скуби, которые, по его мнению, бесполезны и не привносят свой вклад в команду. Расстроенные Шэгги и Скуби уходят играть в боулинг, но там на них нападают роботы-скорпионы. Друзей спасает команда «Ярости Сокола», кумиры Скуби и Шэгги: Синий Сокол (на самом деле, его повзрослевший сын Брайан), робопёс Динамит и Ди-Ди Скайс, пилот корабля. Они объясняют Шэгги и Скуби, что за ними охотится суперзлодей Дик Дастардли, который украл один из трёх черепов Цербера, и теперь нужно помешать ему заполучить оставшиеся два. Однако Дик всё же находит и похищает второй череп.

Фред, Велма и Дафна, узнав, что их друзей атаковали, приезжают в боулинг-клуб и находят сломанного робота. На нём же друзья обнаруживают волос Дика Дастардли. Прочитав информацию о нём в полицейской базе данных, они узнают, что наряду с кражей черепов Цербера Дик украл записи родословных многих собак. Фред, Дафна и Велма едут искать его в «Дастардли Демолишн». В пути Велма, сопоставив украденные Диком родословные собак, определяет, что Скуби — последний потомок Перитаса, пса Александра Македонского, также она узнаёт через соцсети, что Скуби и Шэгги находятся с Синим Соколом.

Робот, найденный троицей в зале боулинга, вновь функционирует и сообщает Дастардли об их перемещении. Дастардли, замаскировавшись под красивую женщину-полицейского, пленяет их. Однако им удаётся выбраться из камеры благодаря одному из роботов и узнать, что третий череп находится в горе Мессик. Троица заходит в комнату с устройством связи, Велма, взломав Динамита, говорит Ди-Ди, где третий череп, но из-за плохой связи не успевает узнать, что со Скуби и Шэгги. В этой же комнате друзья находят доску, раскрывающую планы Дастардли: будучи потомком Перитаса Скуби — единственный, кто может открыть ворота в Подземный мир, где Александр Македонский спрятал свои сокровища. Дастардли опять ловит друзей и раскрывает, что его пёс Маттли застрял в Подземном мире после неудачного эксперимента с порталом, и теперь Дик хочет вернуть его.

Скуби проводит больше времени с командой Сокола, ему создают супер-костюм, но для этого ему приходится снять ошейник — подарок Шэгги, что очень расстраивает парня. Когда «Ярость Сокола» прибывает на гору Мессик, которая имеет мезозойскую экосистему, Шэгги, обиженный поведением Скуби, отказывается идти с ними дальше. Исследуя гору Мессик, Брайан и Скуби сталкиваются с Капитаном Дикарём, хранителем третьего черепа. Чтобы получить его, они должны победить Дикаря в бою на арене. Тем временем к Шэгги приезжает в «Мистической машине» Дастардли, замаскированный под Фреда, и обманом заставляет парня привести его к Скуби. Дастардли похищает и третий череп, и Скуби, заодно выбросив Вэлму, Дафну и настоящего Фреда из своего корабля и уничтожив «Ярость Сокола».

Дастардли прибывает в Парфенон в Афинах, соединяет черепа, которые создают врата в Подземный мир, а «Корпорация тайна» и команда Сокола прилетает на фургоне при помощи Динамита. Дик насильно заставляет Скуби открыть врата, выпустив оттуда гигантского разъярённого Цербера. Дику удаётся проникнуть в Подземный мир, где он находит Маттли; вдвоём они собирают столько сокровищ, сколько могут унести, и сбегают, Скуби же воссоединяется с друзьями и мирится с Шэгги.

«Корпорация тайна», команда Сокола и роботы Дастардли, уставшие от ворчливого характера и небрежного отношения своего создателя, заманивают Цербера обратно в Подземный мир. Ворота закрыты, но чтобы запереть их, Скуби (как потомок Перитаса) и его лучший друг (то есть, Шэгги) должны активировать замок, причём кто-то из них должен сделать это изнутри, навсегда оставшись в Подземном мире. На это героически идёт Шэгги, Скуби также активирует замок, и ворота исчезают. Все начинают оплакивать Шэгги, но появляется портал, откуда парень возвращается.

Роботы пленяют Дика и Маттли. Шэгги снимает маску с Дастардли, и вроде бы кажется, что это Саймон Коуэлл. Однако Вэлма обнаруживает логическую ошибку в его объяснении и снова снимает маску, показывая, что с самого начала это был Дастардли, специально замаскировавшийся под Коуэлла, чтобы рассорить друзей. Команда Сокола уводит его в тюрьму.

Спустя какое-то время корпорация открывает свой штаб, а «Ярость Сокола» дарит им обновленную версию «Мистической машины», поскольку старая была уничтожена в битве с Цербером. «Корпорация „Тайна“», получив звонок, сообщающий, что были обнаружены призрачный корабль и призрак капитана, отправляется разгадывать загадку.

В титрах видно, что герои встречаются с другими персонажами вселенной Hanna-Barbera, а Дик Дастардли и Маттли сбегают из тюрьмы.